Initiate a hummus object — Initiate_Hummus_Object • HuMMuS

Initiate a hummus object

Usage

Initiate_Hummus_Object(
  seurat_assays,
  active.assay = NULL,
  multilayer = NULL,
  motifs_db = NULL
)

Arguments

seurat_assays: A Seurat object or a list of Seurat assays
active.assay: The name of the active assay. Default: NULL
multilayer: A multilayer object. Default: NULL
motifs_db: A motifs_db object. Default: NULL

Value

A hummus object

Examples

seurat_object <- Seurat::CreateSeuratObject(counts = matrix(rnorm(1000), nrow = 100, ncol = 10))
#> Error in loadNamespace(x): there is no package called ‘Seurat’
         hummus <- InitiateHummus_Object(seurat_object)
#> Error in InitiateHummus_Object(seurat_object): could not find function "InitiateHummus_Object"
         hummus
#> Error: object 'hummus' not found